科学家揭示水生植物浮萍进化和处境顺应新机制

  上海交通大学王文琴课题组与中外科研机构互助,诈骗三代PacBio单分子测序本事拼装出高质地的浮萍基因组,揭示了浮萍根系效力和水生植物适当境遇的新机制。干系咨询劳绩指日正在线揭晓于美邦?

  浮萍为宇宙上最小的单据叶着花植物,它生涯于水体中,具有适当性强,散布广,淀粉含量丰裕等特征,是一种精良的生物能源植物,同时能够高效罗致富养分和重金属污染水体中的氮、磷及铜、砷等元素,是一种有使用前景的生物洁净植物。

  2014年邦际上初版浮萍基因组为浮萍效力基因组学和分子生物学咨询供应了强有力的参考序列,而且开启了工业化使用的大门。然而初版基因组是基于二代短读长测序,拼装出了16055个短片断并导致11.8%的序列缺失。

  跟着测序本事和生物新闻学的急速兴盛,王文琴团队与美邦罗格斯大学卫克曼微生物咨询所Joachim Messing院士互助,从新诈骗三代PacBio单分子长读长的测序上风,拼装出的序列接续性比上一版晋升了44倍,填充了上一版95.4%的序列丧失区域,审定到更众的完全LTR序列和嵌套LTR区间,为浮萍的生物学咨询供应了更优质的参考基因组。

  咨询职员从根机合细胞学瞻仰、根发育干系基因发现和根系养分元素罗致材干咨询等方面,说明了浮萍的根系首要是大概根且效力产生鲜明的退化。同时察觉,异于陆生植物的免疫体例,编码抗微生物肽等抗病基因串联反复扩增且构成型外达,与浮萍中24nt siRNA低水准外达好像等,从而巩固了浮萍对病原体和微生物的抗性,巩固了其对水生境遇的适当性,间接佐证了浮萍能够环球散布的精良性格。

  据悉,该咨询由上海交通大学王文琴团队与美邦罗格斯大学卫克曼微生物咨询所Joachim Messing院士互助告竣,上海交通大学博士后安冬和中科院分子植物科学卓着更始核心\植物心理生态咨询所博士后周勇为论文协同第一作家,博士后李永生、咨询生肖俏、王涛、张雅婷插足了该使命。干系使命获得了邦度自然科学基金面上项目标资助。该项目同时获得中科院分子植物科学卓着更始核心\植物心理生态咨询所巫永睿咨询组,晁代印咨询组和中邦农业科学院生物本事咨询所李玉斌咨询员的大举撑持。

  值得一提的是,该论文揭晓后,新泽西州立大学官网首页,EurekAlert等海外众家媒体对该使命做了具体报道。

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